Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPAP2Q8IXW5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms