Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms