Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms