Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF550Q7Z398 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms