Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
WDR88Q6ZMY6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms