Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG16L1Q676U5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms