Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PXDC1Q5TGL8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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