Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL22Q53GT1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms