Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SP6Q3SY56 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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