Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KNOP1Q1ED39 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KNOP1Q1ED39 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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