Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CDO1Q16878 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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