Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FSCN1Q16658 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms