Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYPL1Q16563 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYPL1Q16563 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms