Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms