Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIP13Q15645 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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