Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP10Q15642 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms