Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NECTIN1Q15223 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECTIN1Q15223 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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