Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BRD3Q15059 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms