Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFIXQ14938 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms