Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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COL4A6Q14031 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
COL4A6Q14031 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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