Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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CKAP5Q14008 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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CKAP5Q14008 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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CKAP5Q14008 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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CKAP5Q14008 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CKAP5Q14008 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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CKAP5Q14008 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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CKAP5Q14008 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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