Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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