Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IKZF1Q13422 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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