Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCAPQ12770 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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