Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCNT1Q02742 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms