Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK5Q00535 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDK5Q00535 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms