Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRX6P78412 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRX6P78412 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRX6P78412 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms