Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTG2P63267 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTG2P63267 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms