Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTA2P62736 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTA2P62736 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms