Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MANFP55145 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MANFP55145 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MANFP55145 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MANFP55145 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MANFP55145 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms