Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AP3M2P53677 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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