Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IDH3AP50213 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms