Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSNK1A1P48729 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.3 ms