Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ME1P48163 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ME1P48163 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ME1P48163 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ME1P48163 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms