Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC6A9P48067 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms