Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BRCC3P46736 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BRCC3P46736 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms