Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAPGP40121 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms