Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PSMB9P28065 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMB9P28065 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms