Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPI1P17947 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms