Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ITGA4P13612 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms