Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LAMC1P11047 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMC1P11047 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms