Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM225BP0DP42 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms