Protein–RNA interactions for Protein: P0CG23

ZNF853, Zinc finger protein 853, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF853P0CG23 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF853P0CG23 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms