Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSF3P09919 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSF3P09919 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSF3P09919 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms