Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MMP10P09238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MMP10P09238 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms