Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
THY1P04216 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
THY1P04216 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
THY1P04216 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms