Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABARAPO95166 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms