Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms