Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ1O43426 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms