Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA2O43364 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA2O43364 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms